疾病馆分布在博物馆的2楼，主要介绍了各类疾病的概念，使人们对疾病更加了解。同时对医学史中重要的历史人物展开介绍，记述了他们的贡献，提高了内容的情趣性和故事性。四种常见病构成了四个小展区，分别介绍并展示了人体脊椎标本、人体大脑标本、人体肝脏标本、人体肺部标本，为打造更健康的校园提供了有力的保障。病理展板和300余件人体病理标本构成一个展区，使人们对疾病进一步了解，对医学的发展也予以了介绍，使人们对探索医学产生了更强的情趣和愿望。